MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 chromosome

Total Repeats: 105843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017208	A	7	7	329	335	100 %	0 %	0 %	0 %	384184089
2	NC_017208	AAGC	2	8	339	346	50 %	0 %	25 %	25 %	384184089
3	NC_017208	CAA	2	6	371	376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184089
4	NC_017208	GAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184089
5	NC_017208	TAT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184089
6	NC_017208	TCC	2	6	555	560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384184089
7	NC_017208	GAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184089
8	NC_017208	TTTA	2	8	724	731	25 %	75 %	0 %	0 %	384184089
9	NC_017208	ATC	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384184089
10	NC_017208	GAAT	2	8	840	847	50 %	25 %	25 %	0 %	384184089
11	NC_017208	TTA	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184089
12	NC_017208	ATA	2	6	866	871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184089
13	NC_017208	TAA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184089
14	NC_017208	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184089
15	NC_017208	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184089
16	NC_017208	GAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184089
17	NC_017208	ACC	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384184089
18	NC_017208	AGA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184089
19	NC_017208	TTA	2	6	1088	1093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184089
20	NC_017208	CGC	2	6	1103	1108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384184089
21	NC_017208	CAAAT	2	10	1196	1205	60 %	20 %	0 %	20 %	384184089
22	NC_017208	TAAT	2	8	1265	1272	50 %	50 %	0 %	0 %	384184089
23	NC_017208	AGC	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184089
24	NC_017208	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184089
25	NC_017208	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184089
26	NC_017208	A	6	6	1411	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	384184089
27	NC_017208	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184089
28	NC_017208	TGG	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384184089
29	NC_017208	ACA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184089
30	NC_017208	A	6	6	1547	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	384184089
31	NC_017208	ACT	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384184089
32	NC_017208	GAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184089
33	NC_017208	AGT	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184089
34	NC_017208	TACAA	2	10	1810	1819	60 %	20 %	0 %	20 %	384184090
35	NC_017208	TCT	2	6	1865	1870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384184090
36	NC_017208	ACA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184090
37	NC_017208	GAA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184090
38	NC_017208	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184090
39	NC_017208	A	7	7	2059	2065	100 %	0 %	0 %	0 %	384184090
40	NC_017208	AAAAT	2	10	2114	2123	80 %	20 %	0 %	0 %	384184090
41	NC_017208	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184090
42	NC_017208	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184090
43	NC_017208	CAT	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384184090
44	NC_017208	TA	3	6	2307	2312	50 %	50 %	0 %	0 %	384184090
45	NC_017208	ATA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184090
46	NC_017208	TGT	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384184090
47	NC_017208	TAAG	2	8	2442	2449	50 %	25 %	25 %	0 %	384184090
48	NC_017208	GAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184090
49	NC_017208	TGG	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384184090
50	NC_017208	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184090
51	NC_017208	TAT	2	6	2502	2507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184090
52	NC_017208	TAT	2	6	2523	2528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184090
53	NC_017208	TCT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384184090
54	NC_017208	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184090
55	NC_017208	CAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184090
56	NC_017208	AG	3	6	2584	2589	50 %	0 %	50 %	0 %	384184090
57	NC_017208	GA	3	6	2656	2661	50 %	0 %	50 %	0 %	384184090
58	NC_017208	TTC	2	6	2716	2721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384184090
59	NC_017208	GAA	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184090
60	NC_017208	AT	3	6	2809	2814	50 %	50 %	0 %	0 %	384184090
61	NC_017208	GATG	2	8	2815	2822	25 %	25 %	50 %	0 %	384184090
62	NC_017208	AGTT	2	8	2854	2861	25 %	50 %	25 %	0 %	384184090
63	NC_017208	ATG	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184090
64	NC_017208	ATT	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184090
65	NC_017208	AATT	2	8	2919	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	384184090
66	NC_017208	TACT	2	8	2938	2945	25 %	50 %	0 %	25 %	384184090
67	NC_017208	AAC	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184091
68	NC_017208	AGA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184091
69	NC_017208	ATG	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184091
70	NC_017208	A	6	6	3323	3328	100 %	0 %	0 %	0 %	384184092
71	NC_017208	AAAC	2	8	3406	3413	75 %	0 %	0 %	25 %	384184092
72	NC_017208	A	6	6	3523	3528	100 %	0 %	0 %	0 %	384184092
73	NC_017208	TCTTTG	2	12	3537	3548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384184092
74	NC_017208	A	6	6	3564	3569	100 %	0 %	0 %	0 %	384184092
75	NC_017208	AAC	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184092
76	NC_017208	AT	3	6	3617	3622	50 %	50 %	0 %	0 %	384184092
77	NC_017208	TGA	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184092
78	NC_017208	AGA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184092
79	NC_017208	AAG	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184092
80	NC_017208	TTG	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384184092
81	NC_017208	A	7	7	3792	3798	100 %	0 %	0 %	0 %	384184092
82	NC_017208	AGA	2	6	3953	3958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184092
83	NC_017208	AAG	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184092
84	NC_017208	AAC	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184092
85	NC_017208	TGA	2	6	4100	4105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184092
86	NC_017208	TTC	2	6	4113	4118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384184092
87	NC_017208	ACA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184092
88	NC_017208	ACGA	2	8	4163	4170	50 %	0 %	25 %	25 %	384184092
89	NC_017208	AATT	2	8	4201	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	384184092
90	NC_017208	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184092
91	NC_017208	ACG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184092
92	NC_017208	AACG	2	8	4388	4395	50 %	0 %	25 %	25 %	384184092
93	NC_017208	ATAG	2	8	4413	4420	50 %	25 %	25 %	0 %	384184092
94	NC_017208	AACAAA	2	12	4471	4482	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384184093
95	NC_017208	ATG	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184093
96	NC_017208	GTAT	2	8	4555	4562	25 %	50 %	25 %	0 %	384184093
97	NC_017208	CAC	2	6	4590	4595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384184093
98	NC_017208	ATA	2	6	4615	4620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184093
99	NC_017208	GAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184093
100	NC_017208	ATA	2	6	4678	4683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184093
101	NC_017208	A	6	6	4732	4737	100 %	0 %	0 %	0 %	384184093
102	NC_017208	TTA	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184093
103	NC_017208	TCC	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384184093
104	NC_017208	TGG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384184093
105	NC_017208	TGGCGG	2	12	4793	4804	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384184093
106	NC_017208	TGG	2	6	4817	4822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384184093
107	NC_017208	TGT	2	6	4844	4849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384184093
108	NC_017208	GAC	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184093
109	NC_017208	ATTAA	2	10	5082	5091	60 %	40 %	0 %	0 %	384184093
110	NC_017208	AAAG	2	8	5120	5127	75 %	0 %	25 %	0 %	384184093
111	NC_017208	AAC	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184093
112	NC_017208	AAGTTG	2	12	5236	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184093
113	NC_017208	ATA	2	6	5296	5301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184093
114	NC_017208	GGT	2	6	5316	5321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384184093
115	NC_017208	TTA	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184093
116	NC_017208	GCA	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184093
117	NC_017208	AGC	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184093
118	NC_017208	TTC	2	6	5714	5719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384184093
119	NC_017208	ATT	2	6	5832	5837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184093
120	NC_017208	ATG	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184093
121	NC_017208	ATT	2	6	5892	5897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184093
122	NC_017208	TGG	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384184093
123	NC_017208	TTA	3	9	5959	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184093
124	NC_017208	TAT	2	6	6007	6012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184093
125	NC_017208	TTC	2	6	6018	6023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384184093
126	NC_017208	AAT	2	6	6041	6046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184093
127	NC_017208	AT	6	12	6056	6067	50 %	50 %	0 %	0 %	384184093
128	NC_017208	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384184093
129	NC_017208	A	7	7	6102	6108	100 %	0 %	0 %	0 %	384184093
130	NC_017208	A	6	6	6139	6144	100 %	0 %	0 %	0 %	384184093
131	NC_017208	CCAGC	2	10	6159	6168	20 %	0 %	20 %	60 %	384184093
132	NC_017208	GA	3	6	6202	6207	50 %	0 %	50 %	0 %	384184093
133	NC_017208	GAC	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184093
134	NC_017208	CGTT	2	8	6252	6259	0 %	50 %	25 %	25 %	384184093
135	NC_017208	CGT	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384184093
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